魑魅魍魎肆虐四方的混沌之國――日本。
過去在這裏，發生了一場足以撼動天地的巨大動亂。
謎樣的怪物「噬神者」從地殼之下叢起竄出，
對萬物的主宰者――神明露出反抗的獠牙。

神與人組起共同戰線，與其對抗了百年之久。
最後靠著太陽神・天照大御神
架設起的三大結界，
這場長久的死鬥總算拉下了閉幕。

轉眼時光流逝，來到幻曆十三年。
此時的日本，三大結界其一不知被誰所毀。
世態又逐漸開始動盪不安。

故事的開端，這裡是佇立於西海上的鬼之島。
伴隨著復活的噬神者與襲擊。
一名鬼之子與少女的相遇，讓歷史的齒輪開始轉動――